存在于过去与未来、理智与疯狂、梦幻与现实的是十二猴子军团的秘密。2035年，由于瘟疫，地面不再适宜居住。失去了99％人口的人类移居地下，前途未卜。科尔作为志愿者来到过去，和凯瑟琳·雷利医生循着仅有的2条线索，试图解开十二猴子军团导致人类毁灭的谜团.